先に2500が倒されるように調整して戦うとよいでしょう。その方が、コストオーバーを考慮した総合的な耐久値は高くなります。
先に2000が倒されると、2500が復活する際に耐久値が低い状態で登場します。
2000は序盤、2500の援護をする程度に行動を抑え、うまく耐久値調整をするとよいでしょう。
2500の耐久値が多く残っているのであれば、2000を2回倒されるようにしてもかまいません。その後、2500と2000で一緒に戦うとよいでしょう。
よほどの腕の差が無いと、うまく逃げ切れないと思われます。
2000機体が先に倒されても他の組み合わせよりかはコストオーバーによる影響は軽微のため、諦めずにその後も慎重に戦っていきましょう。